免疫抑製劑包括糖皮質激素類藥物、環孢素以及長春新鹼、環磷醯胺等。該類藥物主要應用於自身免疫性疾病治療當中，種類較多，不同的藥物副作用也不一樣。
1.糖皮質激素類藥物
主要代表藥物有醋酸潑尼松、地塞米松等，長期應用或應用方式不當可引起高血壓、高血糖、骨質疏鬆、滿月臉、水牛背等副作用問題。
2.環孢素
臨床上被廣泛用於治療再生障礙性貧血，長期應用藥物會過度依賴，產生一系列副作用問題，比如毛髮增多、牙齦腫脹、肝功能以及腎功能受損等。
3.長春新鹼、環磷醯胺
這類藥物可抑制骨髓，引發粒細胞減少或缺乏症。長春新鹼還可影響到正常的神經末梢功能，某些患者在應用后可有末梢神經炎，易出現四肢麻木等癥狀。