神牡安神膠囊藥物使用期間有可能會導致患者身體出現過敏、胃部不適、腸道不適等多種副作用，患者出現副作用應停止用藥。
1.過敏：對於藥物成分敏感人群，用藥期間有可能會出現過敏副作用，從而會導致身體出現皮膚瘙癢、喉頭水腫等不良癥狀。患者可以在醫生指導下服用氯雷他定片、鹽酸西替利嗪片等藥物進行治療。
2.胃部不適：神牡安神膠囊使用期間有可能會使胃黏膜受到刺激，從而導致患者身體出現食欲不振、噁心、乾嘔等多種不良癥狀，大多數在停止用藥以後癥狀會自行緩解。
3.腸道不適：個別患者在使用神牡安神膠囊期間，有可能會出現便秘的副作用，通常癥狀較輕，可以通過多喝水改善癥狀。
除以上副作用以外，個別患者還可能會出現其他副作用，如嗜睡、頭暈、乏力等。出現異常問題時，則需要諮詢醫生。