腱鞘囊腫大多數是過度勞損、炎性刺激、關節囊組織退變等因素引起而定，患者可以通過一般治療、藥物治療、手術治療的方式治療。
1、過度勞損：腱鞘囊腫有可能是經常做一些手上的重體力勞動引起的，會引起局部腱鞘長期磨損形成囊腫，要多注意休息，對於恢復會起到幫助作用。
2、炎症刺激：如果肩胛部位長時間受到無菌性炎症刺激，或者是受到病原菌感染，也會逐漸形成囊腫，伴隨著有腫脹和疼痛的癥狀，可以根據醫生指導服用頭孢克肟顆粒、阿奇黴素片、羅紅霉素膠囊等消炎藥物，對於恢復也會有效。
3、關節囊組織退變：隨著年齡的增長，關節囊周圍很可能會有結締組織退變，也不排除會導致腱鞘囊腫，如果患者的病情比較嚴重，可以遵醫囑通過手術的方式切除囊腫進行治療。
除以上常見原因外，還可能是其他因素導致的，例如周圍組織腫瘤，要查找原因后才能對症治療。