腸系膜上靜脈血栓有可能是外傷、門靜脈高壓、凝血功能異常、細菌感染、肝硬化等原因引起，需要根據原因治療，有利於控制病情發展。
1、外傷：有可能是磕碰或是重創等外傷原因引起，使患者的腸系膜局部黏膜組織出現損傷和破裂，可能會引起淤血較多和血栓。可以在醫生指導下使用阿司匹林腸溶片、三七片、雙氯芬酸鈉緩釋片等藥物治療。
2、門靜脈高壓：有可能是肝功能損傷或者肝功能衰竭等原因引起，容易導致自身的門靜脈壓力偏高，使患者的腸系膜受到影響，會引起血液迴流受阻和血栓。需要及時到醫院就診。
3、凝血功能異常：會導致患者身體出現血液聚集，可能會使患者的腸系膜出現血栓生成，使患者局部出現墜脹或者疼痛等癥狀。可以遵醫囑使用阿司匹林腸溶片、辛伐他汀片、雙嘧達莫片等藥物治療。
4、細菌感染：多數是感染了金黃色葡萄球菌或者鏈球菌等原因，會使患者的腸系膜受到刺激，還會伴隨充血，會使局部出現血液堆積和誘發靜脈血栓。可以遵醫囑使用阿莫西林膠囊、頭孢克肟片、硫酸氫氯吡格雷片等藥物治療。
5、肝硬化：該疾病容易使患者的肝功能出現障礙，會導致患者腹腔壓力增大，容易誘發腸系膜局部的靜脈部位有血栓。要及時到醫院就診。
治療期間患者需要定期到醫院檢查身體，還要保持合理健康飲食。如果病情未見好轉，建議及時就醫治療。